大崎駅

島式ホーム4面8線の地上駅で、橋上駅舎をソープランド有している。

当駅で埼京線とりんかい線が相互直通運転を行っており、ホーム・改札ともにJR東日本・TWRの両社で共用されている。

駅舎は五反田寄りと品川寄りとにそれぞれ北改札口と南改札口を持ち、両コンコースは「Dila大崎」（駅ナカ）を介してつながっている。品川寄りのコンコースからの山手線ホームへのエスカレータは、設置位置のホームが狭いために1人用である。また、北改札口からの出口は東口と西口が、南改札口からの出口は新東口と新西口があり、東口および新東口にはゲートシティ大崎などへ、新西口にはThinkParkなどへのペデストリアンデッキがつながっている。

自動改札機はJR東日本とTWRで共用されており、両社の乗車券類・Suica（相互利用できるPASMO・ICOCA・TOICAを含む）での入・出場が可能である。また、自動精算機でTWRの乗車券の精算を行うことは可能だが、精算に大阪風俗パスネットは使用できない。これらの点は、東京地下鉄東西線との接続点である中野駅や西船橋駅とほぼ同条件だが、TWRでは当初からSuicaを利用することが可能であった。

自動券売機もJR東日本のものとTWRのものが設置されている。いずれもJR東日本式のもので、TWRの券売機でもJR線の乗車券を購入することが可能である。なお、乗車券の地紋はJR東日本のもので発行される。

山手線車両の保守整備を担当する東京総合車両センタープロダクションバイトが隣接しており、当駅発着の山手線列車が多数ある（山手線#設備・運転を参照）。また、山手線の運行管理上の分界駅であり、当駅で列車番号を変更する。

山手線では2007年3月18日から時刻表が始発直後・終電直前の3時間のみを掲載するようになったが、2・4番線ではその後も全列車の時刻表が掲載されている。

乗務員交代は山手線と埼京線 - りんかい線の直通列車のみ行う。なお、1番線ホームの線路の反対側に、運転士交代用のホームが設置されている。

山手貨物線は、駅の北方から構内に向けて品川方面に向かう本線と、蛇窪信号場方面に向かう大崎支線とに分岐する。本線側の線路にはホームが設けられていない。かつては大崎支線側の線路にもホームはなく通過線と着発線があり、埼京線が恵比寿発着だった頃は、この着発線を使用して折り返しが行われていた。この大崎支線側の線路には、2002年12月1日から埼京線・湘南新宿ライン・りんかい線用として5 - 8番線のホームが設置された。